Αναπτυξη Συστηματος Προβλεψης Δευτεροταγους Δομης Πρωτεϊνων Με Χρηση Τεχνικων Κοντινοτερων Γειτονων Και Πιθανοτικων Νευρωνικων Δικτυων

Abstract

Το αντικείμενο της παρούσης διπλωματικής εργασίας είναι η ανάπτυξη ενός Συστήματος Πρόβλεψης Δευτεροταγούς Δομής Πρωτεϊνών με Χρήση Τεχνικών Κοντινότερων Γειτόνων και Πιθανοτικών Νευρωνικών Δικτύων.Για την ανάπτυξη, την εκπαίδευση και τον έλεγχο της απόδοσης και ακρίβειας πρόβλεψης του συστήματος χρησιμοποιήθηκε ένα σύνολο δεδομένων που αποτελείται από 513 πρωτεΐνες κάθε είδους.Η αρχιτεκτονική του συστήματος βασίζεται στην ύπαρξη δύο σταδίων πρόβλεψης, κάθε ένα εκ των οποίων αποτελείται από τέσσερις ταξινομητές δύο ειδών: 50 Κοντινότερων Γειτόνων (50-ΚΓ) και Πιθανοτικών Νευρωνικών Δικτύων (ΠΝΔ). Στο 1ο Στάδιο πραγματοποιείται ταξινόμηση σε coil ή non-coil και στην περίπτωση ταξινόμησης της εισόδου σε non-coil, η έξοδος του 1ου Σταδίου τροφοδοτείται στο 2ο Στάδιο, όπου και πραγματοποιείται ταξινόμηση σε έλικα ή πτυχωτή επιφάνεια. Σε κάθε στάδιο το αποτέλεσμα εξάγεται με χρήση κανόνα μέσου όρου με βάρη.