Εφαρμογή Ιεραρχικής Συσταδοποίησης Σε Δεδομένα Γονιδιακής Έκφρασης Cdna Μικροσυστοιχιών Προερχόμενα Από Κυτταρικές Σειρές Λευχαιμίας Επεξεργασμένες Με Γλυκοκορτικοειδή

Abstract

Η τεχνολογία των μικροσυστοιχιών είναι μία σύγχρονη και πολλά υποσχόμενη τεχνολογία που έχει συμβάλλει ενεργά στην πρόοδο που έχει σημειωθεί τα τελευταία χρόνια στο χώρο της βιολογίας και της ιατρικής. Ο σκοπός της διπλωματικής εργασίας είναι η ανάπτυξη ενός αλγόριθμου ανάλυσης δεδομένων cDNA μικροσυστοιχιών που προκύπτουν από κυτταρικές σειρές λευχαιμίας κυττάρων T επεξεργασμένες με γλυκοκορτικοειδή. Ο τύπος της λευχαιμίας που μελετάται είναι η Οξεία Λεμφοβλαστική Λευχαιμία που είναι το είδος λευχαιμίας που εμφανίζεται πιο συχνά σε παιδιά. Μέσω του αλγόριθμου, ο οποίος αναπτύχθηκε σε περιβάλλον Matlab, δίνεται στον αναγνώστη μία ολοκληρωμένη πρόταση επεξεργασίας και ανάλυσης των δεδομένων γονιδιακής έκφρασης, κάνοντας χρήση ανθεκτικών στατιστικών μεθόδων. Οι μέθοδοι προ-επεξεργασίας περιλαμβάνουν τη διόρθωση υποβάθρου, το φιλτράρισμα, το μετασχηματισμό και την κανονικοποίηση των δεδομένων, και οι μέθοδοι ανάλυσης περιλαμβάνουν την ανάλυση των κυρίων συνιστωσών και την ιεραρχική συσταδοποίηση. Τελικός στόχος του αλγόριθμου είναι ο διαμερισμός των δεδομένων σε συστάδες κάνοντας χρήση της ιεραρχικής συσταδοποίησης. Η γενικότητα του αλγόριθμου έγκειται στο γεγονός ότι οι προτεινόμενες μέθοδοι ανάλυσης μπορούν να χρησιμοποιηθούν και σε δεδομένα γονιδιακής έκφρασης που προέρχονται και από άλλα ήδη κυττάρων.