Αυτοματη Εφαρμογη Πλεγματος Σε Εικονες Dna (dna Microarrays) Με Χρηση Τεχνικων Ψηφιακης Επεξεργασιας Εικονων

Abstract

Σκοπός της παρούσας διπλωματικής εργασίας είναι η παρουσίαση της μεθόδου αυτόματης εφαρμογής πλέγματος σε εικόνες DNA και σύγκριση της με κάποιες από τις υπάρχουσες μεθόδους που χρησιμοποιούνται. Προκειμένου να εξαχθούν κάποια ασφαλή συμπεράσματα, οι εικόνες αυτές θα πρέπει να υποστούν μια σειρά από βήματα επεξεργασίας ώστε να μπορούν εύκολα να αναλυθούν περαιτέρω. Ο τρόπος εξαγωγής και ψηφιοποίησης τους αλλά και η σειρά των βιολογικών διαδικασιών που έλαβαν χώρα από την λήψη των δειγμάτων μέχρι και την εκτύπωση των εικόνων βοηθούν στην αναγνώριση των παραγόντων που είναι σημαντικοί για την ανάλυση τους. Σημαντικό ρόλο παίζει η ύπαρξη ή όχι των στιγμάτων καθώς επίσης και η φωτεινότητα τους. Τεχνικές κατάτμησης είναι απαραίτητες, ώστε το κάθε ένα στίγμα να μπορεί να υποστεί την σωστή επεξεργασία για ανάλυση του περιγράμματος και της φωτεινότητας του. Για να είναι μια τέτοια τεχνική κατάτμησης εφικτή, θα πρέπει πρώτα να εφαρμοστεί ένα πλέγμα (grid) πάνω στην εικόνα ώστε να γίνεται εύκολος ο διαχωρισμός των στιγμάτων και η άμεση αναφορά σε συγκεκριμένα στίγματα γνωστών συντεταγμένων.Με βάση αυτά, αναδεικνύεται η ανάγκη μιας μεθόδου αυτόματης εφαρμογής ενός πλέγματος που να ταιριάζει με τις εικόνες οι οποίες μπορεί να έχουν υποστεί παραμορφώσεις διαφόρων μορφών. Στα πλαίσια της διπλωματικής εργασίας, υλοποιήθηκε μια αυτόματη μέθοδος, η οποία μπορεί να αντεπεξέλθει επιτυχώς σε τέτοιες δυσμενείς συνθήκες και να δώσει πολύ ικανοποιητικά αποτελέσματα.