Αξιολόγηση Μεθόδων Κατηγοριοποίησης Δεδομένων Γονιδιακής Έκφρασης Cdna Μικροσυστοιχιών

Abstract

Στην παρούσα διπλωματική εργασία γίνεται αναφορά σε διαφορετικές μεθοδολογίες κατηγοριοποίησηςδεδομένων γονιδιακής έκφρασης με τη χρήση cDNA μικροσυστοιχιών (microarrays). Η τεχνολογίαμικροσυστοιχιών επιτρέπει τη μέτρηση των επιπέδων έκφρασης χιλιάδων γονιδίων μόνο σε ένα πείραμα,δημιουργώντας έτσι μια αφθονία δεδομένων. Τα δεδομένα προκύπτουν από έρευνες που πραγματοποιήθηκανσε διαφορετικά ερευνητικά κέντρα και αφορούν σε δείγματα από τρία είδη καρκινικών όγκων.Αρχικά, στην εισαγωγή της εργασίας, περιγράφεται όλο το σχετικό βιολογικό υπόβαθρο, και ακολουθείεκτενής αναφορά στις τεχνικές με βάση τον προσδιορισμό αλληλουχίας για την παρακολούθηση τωνεπιπέδων της γονιδιακής έκφρασης, καθώς και στις διαφορετικές τεχνολογίες μικροσυστοιχιών. Στη συνέχεια,γίνεται αναλυτική ταξινόμηση του καρκίνου του μαστού, της λευχαιμίας και του καρκίνου του πνεύμονα.Παρουσιάζονται, επίσης, για κάθε μία κατηγορία καρκίνου, έρευνες που αναφέρονται στον προσδιορισμόγονιδίων ανιχνευτών, καθώς και στη χρήση τεχνολογιών και διάφορων αλγορίθμων. Απώτερος στόχος είναι ηβελτίωση του τρόπου θεραπευτικής αντιμετώπισης των συγκεκριμένων καρκινικών τύπων, μέσω τηςανακάλυψης νέων υποκατηγοριών και της καλύτερης ταξινόμησης των υπαρχόντων ειδών καρκίνου.