Please use this identifier to cite or link to this item: http://artemis.cslab.ece.ntua.gr:8080/jspui/handle/123456789/17469
Title: Automatic Parameter Learning in BioImage Analysis Algorithms
Authors: Πήλιουρας, Σωτήριος
Στάμου Γιώργος
Keywords: design centering
parameter learning
image analysis
genetic algorithm
fiji
usability test
segmentation
robustness
parameter tuning
bioimage analysis
Issue Date: 12-Nov-2019
Abstract: Το αντικείμενο της διπλωματικής αυτής εργασίας είναι ο αυτόματος υπολογισμός παραμέτρων σε αλγορίθμους ανάλυσης βιοεικόνας. Ο κλασικός τρόπος χειροκίνητης ρύθμισης των παραμέτρων παρουσιάζει ορισμένους περιορισμούς σε θέματα χρόνου, αποδοτικότητας, χρησιμοποιούμενης μνήμης και απαιτούμενης εμπειρίας του χρήστη. Την ίδια στιγμή η συνεχής αύξηση του όγκου των δεδομένων και των εικόνων στα βιολογικά πειράματα, απαιτεί εύρωστες και ευέλικτες λύσεις στα ζητήματα επεξεργασίας και ανάλυσης βιοεικόνας. Λαμβάνοντας υπόψιν τα παραπάνω προβλήματα, προτείνουμε ως λύση τη χρήση της design centering προσέγγισης. Έτσι λοιπόν, αναπτύξαμε μία εναλλακτική μέθοδο στη ρύθμιση παραμέτρων και την υλοποιήσαμε ως plugin για την πλατφόρμα ανάλυσης εικόνας Fiji. Στη συνέχεια, δοκιμάσαμε την επίδοση του προγράμματος μας για διαφορετικά δεδομένα εικόνων και πραγματοποιήσαμε μια αξιολόγηση ευχρηστίας (usability test). Η επιλογή του design centering για την επίλυση του συγκεκριμένου προβλήματος είχε ενθαρρυντικά αποτελέσματα ενώ η ανατροφοδότηση των συμμετεχόντων από την αξιολογιση ευχρηστιας ήταν αρκετά θετική. Τέλος, συμπεράναμε ότι ο χρόνος λειτουργίας μπορεί σε ορισμένες περιπτώσεις να είναι ένας περιορισμός, κάτι που προτείνεται να διερευνηθεί περαιτέρω για διαφορετικόυς αλγαρίθμους.
URI: http://artemis.cslab.ece.ntua.gr:8080/jspui/handle/123456789/17469
Appears in Collections:Διπλωματικές Εργασίες - Theses

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
final_thesis.pdf10.04 MBAdobe PDFView/Open


Items in Artemis are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.