1. Artemis
  2. ΣΗΜΜΥ
  3. Διπλωματικές Εργασίες - Theses
Please use this identifier to cite or link to this item: http://artemis.cslab.ece.ntua.gr:8080/jspui/handle/123456789/18097
Authors: Δελαπόρτα, Μαρία
Keywords: μικροσυστοιχίες
αλληλουχοποίηση νέας γενιάς
Abstract: Η χρήση μεθοδολογιών εξαιρετικά υψηλής απόδοσης (high throughput) στη βιολογία έχει αυξηθεί πολύ στις τελευταίες δεκαετίες. Οι δύο κύριες τεχνολογίες, δηλαδή οι Μικροσυστοιχίες και η Αλληλουχοποίηση Νέας Γενιάς (NGS), προσφέρουν απαραίτητες και δημοφιλείς μεθοδολογίες για την ανάλυση των δεδομένων της γενωμικής. Αυτό σημαίνει ότι πλέον απαιτείται η ανάπτυξη και εφαρμογή νέων ή βελτιωμένων βιοστατιστικών μεθόδων και εργαλείων βιοπληροφορικής για την ανάλυσή τους, είτε στην ανάλυση δεδομένων μικροσυστυχιών είτε στην ανάλυση δεδομένων αλληλουχοποίησης. Αυτές οι μέθοδοι χρησιμοποιούνται στις Ωμικές Επιστήμες και αναφέρονται σε ολοκληρωμένες βιολογικές μελέτες. Η παρούσα εργασία έχει ως στόχο την συγκέντρωση των σχετικών πληροφοριών μέσω ανασκόπησης της βιβλιογραφίας για τις μαθηματικές και υπολογιστικές μεθόδους που χρησιμοποιούνται στην ανάλυση γενωμικών δεδομένων, ειδικότερα στις προαναφερθείσες μεθόδους. Η ανάλυση Μικροσυστοιχιών έχει εμφανιστεί πολύ νωρίτερα και τα βιολογικά δεδομένα, που έχουν παραχθεί και συνεχίζουν να παράγoνται από αυτή είναι αμέτρητα. Από την άλλη πλευρά, η ανάλυση NGS μπορεί να γίνει σε άγνωστο βιολογικό δείγμα, με την εκ νέου αλληλούχιση, και γι’αυτό τον λόγο είναι πιο ευρέως εφαρμόσιμη, την τελευταία δεκαετία υπάρχει ραγδαία αύξηση των δεδομένων αλληλουχοποίησης σε βάσεις δεδομένων με ανοιχτή πρόσβαση από διάφορα μέρη του κόσμου. Οι δύο προαναφερθείσες μέθοδοι ανάλυσης χρησιμοποιούνται ευρέως και ανά περίπτωση, ανάλογα με τον σκοπό του ερευνητή. Η ανασκόπηση αναφέρεται την αρχή λειτουργίας και την περιγραφή της πειραματικής διαδικασίας τους, καθώς και σε βασικές έννοιες της βιολογίας, για να γίνει κατανοητή η ορολογία που χρησιμοποιείται. Στην συνέχεια, γίνεται συστηματική ανασκόπηση στατιστικών ελέγχων και υπολογιστικών μεθόδων για την επεξεργασία των διαφορετικών δεδομένων, έτσι ώστε τα αποτελέσματα να είναι σωστά και αναπαράξιμα. Ακόμα, διερευνάται η διαδικασία χαρακτηρισμού γονιδίων και, παράλληλα, αναδεικνύονται εφαρμογές στην γονιδιακή οντολογία και την ανάλυση σηματοδοτικών μονοπατιών. Εμφανίζονται, ακόμα, μερικές εφαρμογές μαθηματικής προτυποποίησης. Το θέμα ολοκληρώνεται με τη μελέτη περιπτώσεων στη χρήση Μεγάλων Δεδομένων στη γενωμική και την σημασία που έχουν η εφαρμογές και το προγραμματιστικό περιβάλλον τους, αφού θα φέρουν την νέα επιστημονική επανάσταση σε πολλούς τομείς, συμπεριλαβανομένου του τομέα της φαρμακολογίας, της γεωπονικής και της προσωποποιημένης ιατρικής.
URI: http://artemis.cslab.ece.ntua.gr:8080/jspui/handle/123456789/18097
Appears in Collections:Διπλωματικές Εργασίες - Theses

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
IntegratedMaster_Senior_Thesis_Delaporta.pdf16.28 MBAdobe PDFView/Open
Show full item record


Items in Artemis are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.