Κατηγοριοποίηση κριτηρίων καταλληλότητας σε ασθενείς με σύνδρομο Sjögren

Abstract

Με την διαρκή αύξηση των ιατρικών κειμένων και κατ’ επέκταση των κλινικών δοκιμών και σημειωμάτων, αυξάνεται ταυτόχρονα και η ανάγκη για αυτοματοποιημένους τρόπους λήψης πληροφορίας από αυτά. Σκοπός της παρούσας εργασίας, είναι η ανάπτυξη ενός συστήματος αυτόματης αναγνώρισης οντοτήτων που αφορούν ιατρικές έννοιες σε κριτήρια καταλληλότητας κλινικών δοκιμών, η κατηγοριοποίηση αυτών, και η χρήση του για την εύρεση ασθενών που πληρούν ορισμένα κριτήρια καταλληλότητας σχετικά με το σύνδρομο Sjogren. Στο σύστημα που αναπτύχθηκε, εφαρμόζεται συνδυασμός λεξιλογικών μεθόδων εύρεσης οντοτήτων με χρήση της οντολογίας HarmonicSS, σε συνδυασμό με την βιβλιοθήκη MeSH του National Library of Medicine για την αναγνώριση ιατρικών εννοιών, μαζί με μεθόδους κανόνων, για την εύρεση αρνήσεων και χρονικών περιορισμών στις κλινικές δοκιμές, ενώ επίσης χρησιμοποιήθηκε το σύνολο σχολιασμένων κριτηρίων Chia καθώς και ένα ειδικά σχεδιασμένο σύνολο σχολιασμένων κριτηρίων για την αξιολόγηση του συστήματος. Τέλος αναπτύχθηκε μια ακόμη εφαρμογή, η οποία χρησιμοποιεί την αντλημένη πληροφορία και δεδομένα που έχουν καταγραφεί για ασθενείς με σύνδρομο Σιόγκρεν στα πλαίσια του έργου HarmonicSS, για τον εντοπισμό του πλήθους τους που πληρούν τα κριτήρια σε κάθε μία κλινική δοκιμή.